众人在日军司令部制造骚乱，伺机混进去暗杀细菌专家，舒一曼在城外接应，猴子拿走了细菌专家的笔记本，上面密密麻麻记录了很多试验相关的内容。
赵有亮拿到解药决定把细菌原液留下，让佐藤裕二自己捂着这块烫手山芋。
另一边王拐子配合八路军演了一出好戏，配合外面佯攻城门的舒一曼将众人安全送出城。
赵有亮瘟疫没有痊愈，不能回到队伍里，他决定留在荷香村，这是一方面，更主要的是，荷香村已经进入佐藤的视线，必须争取在最短的时间内，让荷香村民兵变成一支具有战斗能力的队伍。除了能够自保，还可以与八路军互为犄角，与鬼子展开战斗。
一番事件过后，佐藤裕二觉得八路军不可能得到如此多的情报，必然是其中有内应，他决定考验王拐子的忠诚度。
烽火兄弟第16集剧情介绍众人与荷香村的民兵投入了紧张的训练之中，猴子对夏迎春的喜爱表露无遗，甚至拿出了自己传家的宝贝送给夏迎春，没成想夏迎春心里已经有赵有亮了，猴子十分失落。
祖奶奶组织村民在荷香村挖地道，要求地道挖的越隐蔽越好，以便日后对付鬼子。
赵有亮病况初愈，离开荷香村返回八路军营地，与舒一曼见面，他十分感谢舒一曼在城外英勇地配合战斗，舒一曼却觉得一切都是赵有亮的功劳，两个人感情又进一步。
猴子心心念念自己妹妹的下落，眼看众人都安顿下来，自己决定进城寻找妹妹，祖奶奶等人发现后连忙派嘎子和民兵队长齐壮进城，怕猴子陷入危险。
烽火兄弟第17集剧情介绍村里铜板儿喜欢赌博，进城找到夏迎春借钱，说自己是要贩货，赌博的时候碰上了王拐子，王拐子一听铜板儿是荷香村来的，眼珠一转来了计谋，他命令手下将铜板儿带回司令部。
赵有亮和舒一曼计划着完善荷香村的地道，赶在鬼子兵力恢复之前完善荷香村的防御体系。嘎子和大招找到了猴子，要猴子跟他们回荷香村，半路遇上鬼子打了一仗，他们跟猴子一起进城寻找猴子的妹妹。
机缘巧合之下救下了一个差点被鬼子糟蹋的闺女，正是猴子的妹妹，刚刚见面就被鬼子杀害，猴子痛心疾首，决定从此以后彻底加入抗日队伍。
铜板儿受不了王拐子的威吓和利诱，把他所知道的荷香村关于赵有亮、夏迎春等人的消息全都吐露出来。几个孤儿帮助猴子等人出城，张涛牺牲。
烽火兄弟第18集剧情介绍几人从孤儿们偷偷藏的地道逃出城。
妹妹死了以后，猴子一下子成长了很多，和嘎子他们一起立志穿上八路军的军装，夏迎春对他说，你得好好训练立功，就你现在吊儿郎当的样子还想穿军装，猴子下定决定，为了自己，为了死去的大川和妹妹，也为了自己心爱的夏迎春，一定要正经地当上八路军。
荷香村开始热火朝天地地道挖掘工作，马棚里，锅灶下到处都是地道的入口，赵有亮给荷香村出了不少主意，大家都很信服，按照赵有亮的法子开始部署地道，他们要将荷香村的地道连成一片网，互相连通，互相辅助，形成战略战术体系。
夏迎春也加入了地道的挖掘工作，与荷香村众村民的关系也越来越融洽。
